Comptabilité CSE : comparatifs, logiciels et prix (2025)

Le logiciel comptable du CSE est l'outil indispensable de travail du trésorier. En effet, ce dernier est la personne qui gère la comptabilité spécifique du CSE et peut avoir besoin d'un logiciel spécifique pour le faire. 

Avec cette fiche pratique, nous souhaitons donner aux élus les informations sur les meilleurs logiciels comptables, avec un aperçu des avantages d'utiliser un logiciel ou de déléguer la gestion comptable du CSE à des prestataires comptables spécialisés, ainsi que les différents prix du marché.

Découvrez tout ce qu'il faut savoir sur le logiciel comptable du CSE.

Pourquoi un logiciel comptable pour le CSE ?

Alors qu'il n'est souvent pas comptable de formation, le trésorier doit malgré tout présenter une comptabilité conforme aux règles comptables qui incombent au CSE. Cette tâche est d’autant plus ardue en raison de la spécificité de la gestion CSE induite par la séparation des deux budgets et la gestion des activités sociales et culturelles.

C’est pourquoi, il existe des logiciels comptables, qui sont des progiciels intégrés, c’est-à-dire des logiciels pro, mais simple d’utilisation et d'application, dédiés aux CSE afin de faciliter le travail du trésorier.

Un logiciel comptable CSE est un logiciel spécialement conçu pour les comités sociaux et économiques. Ils sont conçus pour aider les CSE et leur trésoriers à :

• La gestion des bénéficiaires des œuvres sociales
• La gestion et le paramétrage comptable des activités sociales et culturelles
• La comptabilité spécifique du CSE au regard de la séparation des deux budgets (budget de fonctionnement & budget ASC).

Comptabilité intégrée CSE, quel intérêt ?

La comptabilité intégrée du CSE signifie qu’une action dans les modules de gestion du CSE sera directement répercutée dans la comptabilité de celui-ci. Par exemple, la saisie d’une vente de billetterie ou de voyage génère automatiquement des écritures comptables dans le budget des ASC.

Il convient de savoir que certaines entreprises ont des logiciels de gestion comptables séparés, aussi appelés ERP (Enterprise Resource Planning), soit système de gestion des ressources de votre entreprise.

On a alors deux logiciels différents, l’un pour la gestion, l’autre pour la comptabilité. La différence d'un logiciel de gestion et comptabilité 100% intégré est que l’ensemble des éléments de gestion et de comptabilité sont étroitement liés.

Un logiciel de gestion séparé et distinct d’un logiciel de comptabilité va offrir l’avantage de pouvoir choisir le meilleur et le plus adapté des logiciels.

A contrario, une comptabilité intégrée va offrir plus de simplicité et une cohérence des données entre la gestion et la comptabilité.

Les avantages d'un logiciel comptable CSE

Nous recommandons au CSE d’avoir un logiciel comptable dédié, car cela présente de nombreux avantages, notamment :

• Un gain de temps : les trésoriers peuvent se concentrer sur d'autres missions à fortes valeurs ajoutées (financement, choix et études projets pour les salariés...).
• Une comptabilité spécifique au regard de la séparation des deux budgets, celui de fonctionnement et des activités sociales et culturelles afin d'obtenir une meilleure transparence des comptes.
• Une diminution du risque d’erreur : en automatisant de nombreuses opérations, les logiciels de comptabilité permettent de réduire les erreurs, de plus, les modèles d’écritures, les tableaux de bord et les états analytiques donnent une vue en temps réel sur la consommation des budgets et les potentiels écarts entre le prévisionnel et le réalisé.
• Une conservation des données dans un coffre-fort numérique des pièces justificatives si besoin.

Déléguer la gestion financière et comptable du CSE à des prestataires

Déléguer la gestion financière et comptable à des prestataires permet d’alléger le trésorier, voire son adjoint, dans son travail, repose sur un gain de temps considérable et évite les erreurs dans la gestion des deux budgets.

Dans quelles situations le CSE peut-il faire appel à un expert ?

Dans les entreprises d'au moins 50 salariés, le CSE peut recourir à un expert-comptable ou un expert agréé, un expert habilité à compter du 1er janvier 2020.  

Le CSE peut décider de faire appel à un expert dans plusieurs situations.

Expertise dans le cadre des trois consultations récurrentes

Le CSE peut recourir à un expert-comptable dans le cadre des trois consultations : la consultation sur les orientations stratégiques de l'entreprise, sur la situation économique et financière de l'entreprise et sur la politique sociale de l'entreprise, les conditions de travail et l'emploi. 

Autres situations de recours à l'expertise

Le CSE peut désigner un expert-comptable dans 4 situations :

• Lorsqu'il est consulté dans le cadre d'une opération de concentration.
• Lorsqu'il fait usage de son droit d'alerte économique.
• Lorsque, dans une entreprise de moins de 50 salariés il est consulté sur un projet de licenciement collectif pour motif économique concernant au moins 10 salariés dans une même période de 30 jours.
• Lorsqu'il est consulté sur une offre publique d'acquisition.

Le CSE peut avoir recours à un expert "qualité du travail et de l'emploi", un expert agréé, dans 3 situations :

• En cas de risque grave.
• En cas d'introduction de nouvelles technologies ou de projet important modifiant les conditions de santé et de sécurité ou les conditions de travail.
• Dans les entreprises d'au moins 300 salariés en vue de préparer la négociation sur l'égalité professionnelle.

Le CSE peut, enfin, avoir recours à un expert "libre", c'est-à-dire qu'il peut faire appel à toute expertise pour préparer ses travaux.  

À qui revient la prise en charge du coût de l’expertise ?

La prise en charge du coût de l'expertise est partagée à la hauteur de 80% pour l'employeur et 20% pour le CSE.

Toutefois, pour le recours à l'expert "libre", l'expert est à la charge totale du CSE. 

Selon quelles modalités l’expert intervient-il ?

L'expert intervient conformément aux dispositions du Code du travail.

La décision et le choix de recourir à un expert appartiennent au CSE. Dès la désignation d'un expert par le CSE, les membres du comité établissent et notifient généralement à l'employeur un cahier des charges.

Quelles sont les possibilités de contestation offertes à l’employeur ?

L'employeur peut saisir le juge judiciaire, le TGI en référé, dans un délai de 10 jours à compter de :

• La délibération du CSE décidant de l'expertise s'il veut contester la nécessité de l'expertise.
• La désignation de l'expert par le CSE s'il veut contester le choix de l'expert.
• La notification du cahier des charges et des informations transmises par l'expert s'il veut contester le coût prévisionnel, l'étendue ou la durée de l'expertise.
• La notification du coût final de l'expertise s'il veut contester le coût.

Quel est le coût d'un logiciel comptable CSE ?

Le prix moyen d'un abonnement logiciel comptable CSE peut varier entre 25€ à 900€. Évidemment, on met ici une fourchette de prix (large), car cela dépend de nombreux facteurs et des fonctions supplémentaires choisies.

Les tarifs étant très divers, nous avons comparé quatre offres de logiciel comptable pour les CSE.

Liste des logiciels et prestataires comptables CSE

Nous avons décidé de recenser la liste des logiciels et prestataires comptables afin d'aider le CSE dans la gestion de sa comptabilité.

Les logiciels et prestataires comptables sont importants sur le marché. De ce fait, pour déterminer votre besoin, nous vous conseillons d'analyser votre recherche de la façon suivante :

• Quel est votre besoin ? Il s'agit de savoir si vous souhaitez un logiciel ou un prestataire comptable ? 
• Quel est l'effectif de votre CSE ? En effet, les gros CSE ont besoin d'un logiciel plus important, voire d'un prestataire, que les petits CSE.
• Quel est votre budget du CSE ?

Pour vous aider, nous vous conseillons une liste des différents logiciels comptables et prestataires comptables présents sur le marché.

Afin de vous aider dans votre recherche, nous avons décidé de les classer en deux catégories : d'une part, les logiciels et d'autre part les prestataires comptables. 

Les logiciels comptables

Les prestataires comptables

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